薬用として日本に渡来した頃は、5〜8弁の単弁で、花茎も小さかったのですが、江戸時代にボタンの栽培が高まり、特に元禄の頃には園芸品種が数多く作り出されました。その頃、蘭学医者として来日していたドイツ人のケッぺルが、この富貴、艶麗なボタンを初めてヨーロッパに紹介しています。
薬用としては根の部分を使うので、薬用を目的として栽培する場合には、白の単弁花のものがよく、開花させずにできるだけつぼみを取り除いて根の発育を促します 。
苗から4〜5年目の秋に根を掘り、よく水洗いして、皮を裂いて堅い木部を取り去り、皮を10cmくらいに切って日干しにします。これが生薬の牡丹皮（ぼたんぴ）です。
日本では長野や奈良で栽培されていますが、中国や韓国からも輸入されています。
ボタンピは配糖体のペオノールを主成分とし、そのほかペオノリット、ペオノサイドを含んでいます。
ほてり・のぼせなどを伴う生理不順、生理痛、慢性の出血などの治療に使用します。1日3〜6gを目安に使用しますが、一般的には他の生薬と合わせて用いることが多く、単独ではあまり使用しません。